走进这座展现重庆及三峡地区辉煌历史的文博殿堂，游客可任意选择四种方式来参观游览。
    首先是模拟三峡自然场景。在“壮丽三峡”展厅内，巨型三峡壁画、用玻璃隔水方式营造的长江、瞿塘峡峡口切割来的瀑石和黑石、巫峡切割来的纤夫石和纤夫路、被誉为“世界第一古代水文站”的白鹤梁题刻切割石刻，让人仿佛置身于雄美壮丽的三峡之中。
    其次是三峡考古遗址再现陈列。考古专家在博物馆内缩小复原出土改写亚洲人类起源历史的“巫山人”的龙骨坡遗址；拥有5千年“通史”文化积层、出土文物20余万件的忠县中坝遗址，被整体截取12米深的地层剖面作为留存，来阐释其意义。
    互动式游览是三峡博物馆的最大特色，在模拟的三峡考古场景中，专业人士指导进行勘探和发掘等考古活动。用于此活动发掘的陶片均出土于三峡库区，可作为纪念品由参加者保存。此外参观者还可以在专业人员指导下，进行瓷器、陶器的复制仿制活动，甚至尝试修复文物等。
    数字参观方式主要是指参观者可通过博物馆内数十台电子触摸显示屏、液晶电视显示器和360度数字环幕电影来了解、感知三峡风光和文物。